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産業情報ガイド「製造業に関する統計」（https://rnavi.ndl.go.jp/research_guide/entry/theme-honbun-102151.php）を確認したところ、製造業に関する基幹統計の一つである「工業統計調査」（インターネット情報1）で製造品出荷額が調べられることがわかりました。なお、「経済センサス‐活動調査」（インターネット情報2）実施の年は同調査に統合されます。

ここで紹介する政府統計は政府統計ポータルサイトe-Stat（https://www.e-stat.go.jp/）でも公開されています。「統計データを探す」の「組織から探す」の「経済産業省」から該当する統計を選択し、閲覧することができます。2018年1月時点での最新情報は、「経済センサス‐活動調査」です。インターネットの最終アクセス日は2018年1月30日です。

インターネット情報1
「工業統計調査」経済産業省（http://www.meti.go.jp/statistics/tyo/kougyo/）
日本の工業の実態を明らかにすることを目的としています。事業所数、従業者数、製造品出荷額、原材料使用額などを調査しています。
「品目編」のなかにある製造品に関する統計表「品目別、従業者規模別の産出事業所数及び出荷額（従業者4人以上の事業所）」で産出事業所数と出荷額がわかります。
菓子に関する分類は「洋生菓子」「和生菓子」「ビスケット類、干菓子」「米菓」「あめ菓子」「チョコレート類」「他に分類されない菓子」があります。

インターネット情報2
「経済センサス‐活動調査」経済産業省（http://www.meti.go.jp/statistics/tyo/census/index.html）
事業所・企業の基本的構造を調査する「経済センサス‐基礎調査」と事業所・企業の経済活動の状況を調査する「経済センサス‐活動調査」の2つから成り立っています。この「経済センサス-活動調査」の製造業に関する集計は、「工業統計調査」に相当します。
「産業別集計（製造業）」の「品目編」のなかに製造品に関する統計表第5表「品目別、従業者規模別の産出事業所数及び出荷額（従業者4人以上の事業所）」が掲載されています。

「平成28年経済センサス‐活動調査」によると、従業者数100人以上の事業所の「洋生菓子」の出荷額は594,268百万円、「和生菓子」の出荷額は294,869百万円となっています。


国立国会図書館提供調べ方ページ「リサーチ・ナビ」には、以下のコンテンツがあります。上記以外にも多くの資料やインターネット情報源を案内しています。
「食品産業について調べるには（統計・名鑑・インターネット情報源等）」
（https://rnavi.ndl.go.jp/research_guide/entry/theme-honbun-102142.php）